柴油濾清系統(tǒng)的除水方式主要是沉淀。或是在濾清器的下部設一沉淀腔，或是采用專門的沉淀器。無論是濾清器下部的沉淀腔，還是專門的沉淀器都設有放水閥，當水積聚到一定量時開閥放水，也稱為油水分離器。

油水分離器是燃油濾清器的一種，主要的作用就是除去柴油中的水分，以降低噴油嘴故障，延長發(fā)動機的使用壽命。

原理主要是根據(jù)水和燃油的密度差，利用重力沉降原理去除雜質(zhì)和水份的分離器，內(nèi)部還有擴散錐，濾網(wǎng)等分離元件。油水分離器還有別的功能，如對燃油進行預加熱防止結蠟，過濾雜質(zhì)等。

國三標準下采用高壓共軌發(fā)動機的車型對柴油的質(zhì)量要求也更高，因為高壓噴油嘴需要精確的控制噴油壓力、噴油時間和噴油量，所以要求做工也比較精致。

如果柴油里面有水或雜質(zhì)沒有過濾干凈，會對噴油嘴內(nèi)的柱塞偶件形成磨損造成拉傷，直到噴油器卡死。噴油器損壞會造成發(fā)動機加速不穩(wěn)定或加速無力，或者排放黑煙等故障，影響車輛的正常運行。

 作為多級濾清器系統(tǒng)的第一級，燃油粗濾器就具有濾除大顆粒雜質(zhì)和水分的功能。國三排放標準對燃油壓力的要求，濾清器的水分離效率要求達到95%，但許多粗濾器并不能達到這樣的過濾效果，時間一長就會對發(fā)動機造成損傷。
      為了能讓發(fā)動機“喝到”清潔的好柴油，只有對那些不達標的油再進行一個“二次加工”了，再加裝一套油水分離器是較簡單實用的方法了。